種質冷凍保存平臺依托于中國水產科學研究院黃海水產研究所，主要包括精子庫、胚胎細胞庫、基因庫，是我國重要的水產養殖動物精子、細胞保藏及基因資源利用的專業平臺，致力于我國水產養殖動物的種質收集、保藏以及基因功能挖掘。
在“十五”、“十一五”“十二五”期間，在國家863計劃、國家自然科學基金的資助下，種質冷凍保存平臺已完成多種海淡水魚類及其它水產動物的精子的冷凍保存研究，建立了這些水生動物精子的超低溫冷凍保存技術，共收集42種海淡水魚類的精子，保存魚類精子8000份以上；并且將冷凍精子應用到魚類選擇育種、雜交育種和性別控制等研究領域，促進了我國海水魚類遺傳育種和苗種繁育的發展。在胚胎冷凍保存方面，平臺研究團隊在國際上首次建立了海水魚類胚胎玻璃化冷凍技術，突破了海水魚類胚胎冷凍保存技術難關，多次獲得冷凍復活的胚胎和魚苗。目前開展了牙鲆、鱸魚、大菱鲆、真鯛、星斑川鰈、七帶石斑魚和云紋石斑魚等名貴水生動物胚胎的冷凍保存研究，建立了海水魚類超低溫冷凍保存技術，使冷凍胚胎成活率和孵化率分別達到9.71%-12.15%和23.16%。在海水魚類細胞培養和細胞系建立方面，平臺研究團隊在國內率先開展了魚類胚胎干細胞培養和基因打靶的研究，建立了花鱸和真鯛胚胎干細胞系，開辟了我國海水魚類胚胎干細胞和基因打靶研究新領域；發明了魚類胚胎細胞分離培養方法，建立了20多個海水魚類細胞系和細胞庫1座。目前，共建立魚類細胞系（株）24個，每種細胞系保存份數約100份，為我國魚類胚胎干細胞、組織細胞系建立技術的研究及細胞庫建立奠定了雄厚的科研技術儲備。在基因信息資源方面，平臺研究團隊利用新一代測序技術對半滑舌鰨和牙鲆的基因組進行了測序、組裝和分析，繪制了精細圖譜，并構建了染色體圖譜；對半滑舌鰨和牙鲆早期發育各階段及眼睛變態相關的樣本進行了轉錄組測序和分析，在不同樣本的比較中篩選出6000-13000個差異表達基因；對半滑舌鰨、牙鲆、大菱鲆、條斑星鰈和圓斑星鰈等海水魚進行了遺傳連鎖圖譜和物理圖譜的構建。
未來5-10年，平臺將收集保存100種、10000份以上各種水生動物精子，10種以上水產動物胚胎，包括海洋軟體動物、甲殼類、珍稀和優良經濟魚類胚胎，50種以上水產動物的細胞系，完成5種海水魚類的全基因組精細圖譜的繪制。致力于成為中國保存種類和樣品備份最多、規模最大、功能最強的公益性漁業種質資源細胞庫，同時建成與細胞庫實物一一對應的標準和規范的數據檔案，對每份保存樣品的來源、屬性、特征、保存狀態及應用范疇都制定規范，與國內外科研機構實現信息聚合和共享、樣品交換、樣品應用等國內外合作交流，向國內外科研與產業單位提供服務，也將技術廣泛應用于海水養殖動物病源分離、疫苗研制、病害防治、基因打靶、基因功能分析和應用、細胞工程育種、動物克隆和物種保護等領域，推進海水養殖的可持續發展、海洋動物資源的保護、合理開發和利用。
在“十五”、“十一五”“十二五”期間，在國家863計劃、國家自然科學基金的資助下，種質冷凍保存平臺已完成多種海淡水魚類及其它水產動物的精子的冷凍保存研究，建立了這些水生動物精子的超低溫冷凍保存技術，共收集42種海淡水魚類的精子，保存魚類精子8000份以上；并且將冷凍精子應用到魚類選擇育種、雜交育種和性別控制等研究領域，促進了我國海水魚類遺傳育種和苗種繁育的發展。在胚胎冷凍保存方面，平臺研究團隊在國際上首次建立了海水魚類胚胎玻璃化冷凍技術，突破了海水魚類胚胎冷凍保存技術難關，多次獲得冷凍復活的胚胎和魚苗。目前開展了牙鲆、鱸魚、大菱鲆、真鯛、星斑川鰈、七帶石斑魚和云紋石斑魚等名貴水生動物胚胎的冷凍保存研究，建立了海水魚類超低溫冷凍保存技術，使冷凍胚胎成活率和孵化率分別達到9.71%-12.15%和23.16%。在海水魚類細胞培養和細胞系建立方面，平臺研究團隊在國內率先開展了魚類胚胎干細胞培養和基因打靶的研究，建立了花鱸和真鯛胚胎干細胞系，開辟了我國海水魚類胚胎干細胞和基因打靶研究新領域；發明了魚類胚胎細胞分離培養方法，建立了20多個海水魚類細胞系和細胞庫1座。目前，共建立魚類細胞系（株）24個，每種細胞系保存份數約100份，為我國魚類胚胎干細胞、組織細胞系建立技術的研究及細胞庫建立奠定了雄厚的科研技術儲備。在基因信息資源方面，平臺研究團隊利用新一代測序技術對半滑舌鰨和牙鲆的基因組進行了測序、組裝和分析，繪制了精細圖譜，并構建了染色體圖譜；對半滑舌鰨和牙鲆早期發育各階段及眼睛變態相關的樣本進行了轉錄組測序和分析，在不同樣本的比較中篩選出6000-13000個差異表達基因；對半滑舌鰨、牙鲆、大菱鲆、條斑星鰈和圓斑星鰈等海水魚進行了遺傳連鎖圖譜和物理圖譜的構建。
未來5-10年，平臺將收集保存100種、10000份以上各種水生動物精子，10種以上水產動物胚胎，包括海洋軟體動物、甲殼類、珍稀和優良經濟魚類胚胎，50種以上水產動物的細胞系，完成5種海水魚類的全基因組精細圖譜的繪制。致力于成為中國保存種類和樣品備份最多、規模最大、功能最強的公益性漁業種質資源細胞庫，同時建成與細胞庫實物一一對應的標準和規范的數據檔案，對每份保存樣品的來源、屬性、特征、保存狀態及應用范疇都制定規范，與國內外科研機構實現信息聚合和共享、樣品交換、樣品應用等國內外合作交流，向國內外科研與產業單位提供服務，也將技術廣泛應用于海水養殖動物病源分離、疫苗研制、病害防治、基因打靶、基因功能分析和應用、細胞工程育種、動物克隆和物種保護等領域，推進海水養殖的可持續發展、海洋動物資源的保護、合理開發和利用。